Больница многие годы является базой профильных кафедр медицинского университета и активно сотрудничает с ними, как в лечебно-диагностической работе, так и в совместных научно-практических исследованиях. Большое внимание уделяется ускорению внедрения в практику современных медицинских технологий. В различных научных медицинских журналах, материалах научных конференций и съездов можно встретить публикации наших сотрудников, посвященные актуальным проблемам медицинской науки.
В КГБУЗ «Городская больница № 12, г. Барнаул» размещены:
Клинические базы АГМУ
- кафедры общей хирургии, оперативной хирургии и топографической анатомии — зав. кафедрой Цеймах Е.А.;
- кафедры пропедевтики внутренних болезней им. профессора З.С. Баркагана — зав. кафедрой Котовщикова Е.Ф.;
- кафедры сестринского дела — зав. кафедрой Федоров Д.В.;
- кафедры госпитальной терапии и эндокринологии — зав. кафедрой Андриенко А.В.;
- кафедры педиатрии с курсом ДПО — зав. кафедрой Выходцева Г.И..
База ББМК — директор Толматова В.В.